Application Note 476 - EV isolation
APPLICATION NOTE No. 476

고속원심분리와 초원심분리를 이용한
지방유래줄기세포(hADSC) 유래 소형 세포외소포체(EV) 분리

DASbox® Mini Bioreactor System과 BioBLU® 0.3c 일회용 바이오리액터로 배양한 hADSC 조건화 배지에서, High-Speed Centrifuge CR22N과 Ultracentrifuge CP100NX를 이용해 4시간 이내에 순수하고 균질한 소형 EV(엑소좀)를 분리하는 워크플로우를 확인해 보세요.

분리 방식
고속원심분리(CR22N) + 초원심분리(CP100NX), 수크로스 쿠션 기법
핵심 조건
100,000 × g · 4 °C · 90분 × 2회
주요 결과
약 100 nm 부근 균질한 단일 피크, 전체 공정 4시간 미만

엑소좀 분리, 왜 재현성이 중요한가

엑소좀(30~150 nm)을 포함한 세포외 소포체(EV)는 핵산·단백질·지질 등 생체분자를 세포 간에 전달하며, 질환 바이오마커 및 차세대 약물전달체로 주목받고 있습니다. 그러나 낮은 수율과 표준화된 생산 플랫폼의 부재는 여전히 해결해야 할 과제입니다.

본 노트에서는 지방유래 줄기세포(hADSC)를 마이크로캐리어 기반으로 배양한 뒤, 고속원심분리와 초원심분리를 병합하여 소형 EV를 빠르고 간편하게 분리하는 공정을 소개합니다.

Figure 1. hADSC 유래 소형 EV 분리 워크플로우
Figure 1. BioBLU 0.3c 일회용 바이오리액터 배양부터 고속·초원심분리를 거쳐 소형 EV를 수집하기까지의 전체 워크플로우

실험 방법

1. BioBLU 0.3c에서 hADSC 배양

hADSC를 Synthemax® II 마이크로캐리어에 접종하여 DASbox Mini Bioreactor System에 장착된 BioBLU 0.3c 일회용 바이오리액터에서 배양(교반 80 rpm, DO 40%, 37 °C, pH 7.2)했습니다. 5일간 증식 후 배지를 RoosterCollect-EV로 교체하여 48시간 동안 EV를 수집했으며, 최종 세포 생존율은 97%, 밀도는 1.96 × 10⁶ cells/mL를 기록했습니다.

2. 고속원심분리 3단계 정제

1500 × g, 10분
살아있는 세포와 마이크로캐리어 비드 제거
22,000 × g, 10분
세포 찌꺼기, 사멸세포, 아포토시스 소체 제거
320,000 × g, 20분
마이크로베지클 등 큰 EV 제거, 소형 EV만 남김

세 단계 모두 고정각 로터 R15A를 장착한 High-Speed Centrifuge CR22N을 사용했으며, 10 × 50 mL + 10 × 15 mL 튜브를 동시에 수용해 두 바이오리액터(총 650 mL)의 배지를 1시간 이내에 한 번에 정제할 수 있었습니다.

3. 초원심분리 – 직접법 vs 수크로스 쿠션법

정제된 배지는 스윙버킷 로터 P32ST를 장착한 Ultracentrifuge CP100NX로 100,000 × g에서 90분씩 2회 원심분리했습니다. 40PET 튜브(6 × 40 mL)를 사용해 두 바이오리액터 전체 배지 처리에 단 2회의 러닝만 필요했습니다. 직접 초원심분리법과 튜브 바닥에 30% 수크로스 쿠션을 둔 방법을 비교했습니다.

Figure 2. 직접 초원심분리 vs 수크로스 쿠션 기법 펠렛 비교
Figure 2. 수크로스 쿠션 미사용 시 응축된 펠렛(왼쪽), 수크로스 쿠션 사용 시 확산된 형태의 펠렛(오른쪽)이 형성됨

4. 특성 분석

분리된 소형 EV는 Dynamic Light Scattering(DLS)으로 입자 크기 분포를, 투과전자현미경(TEM)으로 형태를, CD63 ELISA로 엑소좀 마커 발현을 각각 분석했습니다. RoosterCollect-EV 배지는 음성 대조군으로 사용했습니다.

결과 및 고찰

KEY RESULT
수크로스 쿠션을 사용한 소형 EV는 약 100 nm 부근에서 좁고 균질한 단일 피크를 형성한 반면, 미사용 시에는 더 크고 이질적인 분포를 보였습니다.

DLS 및 TEM 분석 결과, 수크로스 쿠션을 사용하지 않은 소형 EV 집단은 입자가 더 크고 이질적이었던 반면, 수크로스 쿠션을 사용한 분획은 더 작고 균질하며 잔여물도 적었습니다. CD63 ELISA에서는 두 분리법 간 엑소좀 마커 발현의 상대적 풍부도가 유사하게 나타나, 두 방법 모두 소형 EV 수득률을 잘 확보함을 확인했습니다.

Figure 3. DLS 및 ELISA 분석 결과
Figure 3. 수크로스 쿠션 사용 유무에 따른 소형 EV의 DLS 크기 분포(좌) 및 CD63 ELISA 정량 결과(우)

이 워크플로우의 장점

빠른 공정 시간
고속원심분리부터 초원심분리까지 전체 공정이 4시간 이내에 완료되어 침전법·여과법보다 신속합니다.
대용량 처리
CR22N + R15A는 650 mL를, CP100NX + P32ST는 240 mL를 1회 러닝에 처리해 반복 작업을 줄입니다.
순도·균질성 확보
수크로스 쿠션 기법으로 화학 시약 오염 없이 균질하고 손상되지 않은 소형 EV를 수집합니다.

사용 장비 및 로터 사양

장비 / 로터 용량 최대 속도
Centrifuge CR22N + Rotor R15A 10 × 50 mL + 10 × 15 mL (최대 650 mL) 32,300 × g
Ultracentrifuge CP100NX + Rotor P32ST 6 × 40 mL (최대 240 mL) 803,000 × g

hADSC 유래 소형 EV 분리,
귀 연구실 환경에 맞는 솔루션을 상담해 드립니다.

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